Anotação e caracterização da família de genes NLRs em Coffea canephora Pierre e Psidium guajava L, foco:busca de ortólogos a GENES DE RESISTÊNCIA A NEMATOIDES e diversidade de germoplasma.
Nome: LAYRA DE MEDEIROS CARDOZO
Tipo: Dissertação de mestrado acadêmico
Data de publicação: 30/03/2022
Orientador:
Nome |
Papel |
|---|---|
| MARCIA FLORES DA SILVA FERREIRA | Orientador |
Banca:
| Nome |
Papel |
|---|---|
| ADÉSIO FERREIRA | Coorientador |
| GILZA BARCELOS DE SOUZA | Coorientador |
| IANA PEDRO DA SILVA QUADROS | Examinador Externo |
| MARCIA FLORES DA SILVA FERREIRA | Orientador |
| PEDRO HENRIQUE DIAS DOS SANTOS | Examinador Externo |
Resumo: Coffeacanephora e Psidiumguajava são espécies agroeconomicamente importantes que sofrem perdas de produtividade ocasionadas pelos nematoides das galhas. A identificação de genes ortólogos a genes de resistência e conhecimentos moleculares a respeito destes, contribuem para o entendimento da interação planta-patógeno e para estratégias mais eficazes no melhoramento de plantas. A família gênica NBS-LRR é a principal classe dos genes de resistência e é extensivamente estudada em diversos genomas de plantas para a prospecção de genes de resistência. O objetivo deste trabalho foi identificar e caracterizar genes da classe NBS-LRR (NLRs) em C. canephora e P. guajava, além de realizar análises filogenéticas e de diversidade. Por meio de ferramentas e métodos de bioinformática, foram realizadas identificação e caracterização de genes NLRs e construção de árvores filogenéticas proveniente de análise de máxima verossimilhança nas duas espécies, além de análises de polimorfismo dos NLRs e da diversidade destes genes em genótipos da coleção de germoplasma de C. canephora do sul do Espírito Santo. 649 e 279 genes NLRs foram identificadas em café e em goiabeira, respectivamente, e demonstraram diversidade em suas características; em C. canephora ocorreu maior quantidade de genes não-TIR enquanto P. guajava maior quantidade foi TIR; 18 genes NLRs de café e 18 genes NLRs de goiabeira são promissores RGAs com destaque para evm.model.ctg40.285 que agrupou em um clado intimamente com a proteína codificada por Gro1-4 que e confere resistência à G. rostochiensis; foi observado diversidade de genes NLRs no germoplasma analisado. Desta forma, o estudo contribuiu para conhecimentos, identificação e caracterização da família NBS-LRR em plantas, além de selecionar promissores ortólogos de genes de resistência.
