Associação genômica ampla para caracteres de frutos e grãos relacionados à qualidade de bebida de Coffea canephora

Nome: VINICIUS ALVES PORTO RODRIGUES

Data de publicação: 19/02/2025

Banca:

Nomeordem decrescente Papel
ADESIO FERREIRA Examinador Interno
CAMILA FERREIRA DE AZEVEDO Examinador Externo
IASMINE RAMOS ZAIDAN Examinador Externo
JOAO FELIPE DE BRITES SENRA Examinador Interno
MARCIA FLORES DA SILVA FERREIRA Presidente

Resumo: Coffea canephora cultivada engloba os grupos botânicos Robusta e Conilon e tem sido
explorado para a produção de cafés especiais. No melhoramento de café os caracteres de
frutos e grãos relacionados à qualidade da bebida ainda são pouco explorados e ampliar a
compreensão da relação dos dados fenotípicos, com os fatores genéticos, são essenciais para
a adoção de estratégias de melhoramento eficientes. Este estudo teve como objetivo
identificar regiões cromossômicas associadas a nove características de frutos e grãos de C.
canephora (grupo Conilon), relacionadas à qualidade da bebida, em uma população de 441
indivíduos do Sul do Espírito Santo. Além disso, foi avaliada a diversidade genética dessa
população com dados fenotípicos de dois anos, fenotípicos corrigidos por modelos mistos e
diferentes marcadores moleculares, incluindo SNPs aleatórios, SNPs associados a
características fenotípicas e SilicoDArT, analisados em um subconjunto de 250 indivíduos.
Foram identificadas regiões cromossômicas associadas a nove características de fruto e grão
em C. canephora, ampliando o entendimento da base genética que influencia a qualidade da
bebida. Os resultados revelaram padrões distintos na distribuição de SNPs, com forte
correlação entre porcentagem de frutos boia e uniformidade de maturação, enquanto o peso
dos frutos restantes apresentou uma arquitetura genética mais complexa. Além disso, os
achados destacam os desafios na correlação entre dados genômicos e fenotípicos, devido à
influência ambiental e à herança poligênica. No entanto, a correlação significativa entre
safras e a matriz Ajust indica um componente genético estável. A alta correlação entre a
matriz genômica completa (1.614 SNPs) e o subconjunto significativo (202 SNPs) sugere
que um número reduzido de marcadores pode representar eficientemente o pool genético,
otimizando análises futuras.

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