Tópicos Especiais em Genômica
Código: PGGM1054
Curso: Mestrado Acadêmico em Genética e Melhoramento
Créditos: 4
Carga horária: 60
Ementa: Estudo da estrutura, organização e evolução de genomas eucariotos, com ênfase em plantas.
Abordagem das metodologias de sequenciamento de DNA e RNA, montagem e anotação de
genomas, além de prospecção de polimorfismos. Introdução a análises de epigenômica e
transcriptômica, incluindo tecnologias de sequenciamento de última geração e ferramentas
bioinformáticas aplicadas. Discussão de aplicações em genética vegetal, análises genômicas e
melhoramento vegetal.
Bibliografia: BROWN, T.A. Genomes 5. Garland Science, 2023.
GOODWIN et al. Coming of age: ten years of next generation sequencing technologies. Nature
Reviews Genetics, 17, 2016.
CANAL et al. RNA-Seq: principais conceitos e cuidados. In: Tópicos especiais em genética e
melhoramento II [recurso eletrônico]. (Org) Fábio Demolinari de Miranda et al. Alegre, ES:
CCA-UFES, 2018. 310 p.
GIBSON, G. AND MUSE, S.V. A Primer of Genome Science (3ed), Sinauer Associates, Inc.
Publishers, Sunderland, Massachusetts. 2009.
LEWIN, B. Genes XII. Jones & Bartlett, 2018.
PAMPHILE et al. Bioinformática: guia básico de princípios e práticas de análise de DNA.
Maringá: Eduem, 2018. 187p.
HARRIGAN, GG.; MARTINO-CATT, S.; GLENN, KC. Metabolomics, metabolic diversity and
genetic variation in crops. Metabolomics, v. 3, p. 259–272, 2007.
FELSENSTEIN J (2003) Inferring phylogenies.
GRAUR D & LI WH (2000) Fundamentals of Molecular Evolution.
HALL B (2007) Phylogenetic trees made easy: a how-to manual.
HENNIG W; DWIGHT-DAVIS D; ZANGERL R (1999) Phylogenetic systematics.
WILEY EO; LIEBERMAN BS (2011) Phylogenetics: Theory and Practice of phylogenetic
systematics