Desenvolvimento de teste de DNA para identificação de clones de Coffea canephora visando a regulamentação da comercialização de mudas'
Resumo: Coffea canephora é de grande importância socioeconômica no Espírito Santo, e duas variedades botânicas são
cultivadas: conilon e robusta. Os clones de cultivares comerciais de C. canephora, são distintos por descritores
morfológicos da espécie de alta herdabilidade, os quais servem para a determinação da distinção, uniformidade e
estabilidade visando registro e proteção de novos clones e cultivares. Entretanto, pode ocorrer que genótipos
relacionados tenham características fenotípicas similares e, portanto, há necessidade de incrementar ferramentas
moleculares para auxiliar a acurada e precisa discriminação de genótipos comerciais. Estas ferramentas moleculares,
denominadas marcadores moleculares de DNA, são independentes da ação do ambiente, da fase de desenvolvimento
da planta ou de parentesco. O uso de um conjunto de marcadores moleculares caracterizados é uma estratégia
eficiente na discriminação de genótipos individuais, os quais podem ser utilizados na obtenção de uma impressão
digital molecular (fingerprint), facilitando a discriminação e a distinção de genótipos com grau de parentesco daqueles
com fenótipos similares. Os marcadores moleculares microssatélites ou SSR (Simple Sequence Repeats) e SNPs são
ferramentas informativas e efetivas para obtenção de perfis de DNA individuais. Para o uso destas ferramentas é
necessário selecionar um conjunto de marcadores marcadores polimórficos e de fácil reprodução, a fim de se obter um
banco de dados de frequências alélicas, visando a identificação segura de qualquer genótipo, o que podem servir como
descritor individual e auxiliar em processos de comercialização; bem como análises adicionais como análises de:
diversidade genética de coleções; de determinação de relações de parentesco; de detecção de misturas varietais e; de
analise de a diversidade entre e dentro de cultivares. Portanto, um conjunto de marcadores de DNA testados,
otimizados, caracterizados e validados constituem uma ponderosa ferramenta biotecnológica para auxiliar o
melhoramento. Para estudos de fingerprint molecular, os marcadores microssatélites são os mais utilizados, por serem
locus específico, codominantes e multialélicos, e terem alto grau de polimorfismo, reprodutibilidade, repetibilidade, por
outro lado o uso de SNPs genômicos pode contribuir para a detecção de marcadores genômicos eficientes na
discriminação de grupos varietais como conilon e robusta. Neste trabalho objetiva-se selecionar um conjunto de loci
SSR altamente polimórficos para estabelecer um padrão molecular único de genótipos (fingerprinting), criar um banco
de dados de perfis de DNA e frequências alélicas de genótipos de C. canephora. Este conjunto de SSRs permitirá que
seja feito, de forma rápida e eficaz, o fingerprint de genótipos de C. canephora, com fácil replicação e de grande
aplicabilidade agronômica. Para isso, serão testados marcadores SSR, e os selecionados pelo maior conteúdo de
polimorfismos serão marcados com fluoróforos para a realização de eletroforese capilar e análise de fragmentos em
uma população de genótipos. Por fim, serão realizados estudos de genética de populações com os dados obtidos, além
de validação dos perfis moleculares com clones comerciais. Além disto, o desenvolvimento de uma ampla base de
dados de SNPs genômicos dos grupos varietais Robusta e Conilon, servirá para a identificação e discriminação
genômicas das mesmas. Os resultados deste trabalho poderão fornecer bases teóricas e técnicas para a
comercialização e fiscalização de mudas.
Data de início: 01/06/2024
Prazo (meses): 60
Participantes:
Papel |
Nome |
|---|---|
| Coordenador | MARCIA FLORES DA SILVA FERREIRA |
| Pesquisador | FRANCINE ALVES NOGUEIRA DE ALMEIDA |
| Pesquisador | JOÃO FELIPE DE BRITES SENRA |
| Pesquisador | CAROLINA DE OLIVEIRA BERNARDES |
